MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Frankia symbiont of Datisca glomerata plasmid pFSYMDG01

Total Repeats: 217

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015664	GGA	2	6	389	394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176125
2	NC_015664	CGC	2	6	407	412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176125
3	NC_015664	CACG	2	8	472	479	25 %	0 %	25 %	50 %	336176125
4	NC_015664	GCG	2	6	508	513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176125
5	NC_015664	CGG	2	6	581	586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176125
6	NC_015664	AGG	2	6	655	660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176125
7	NC_015664	AC	3	6	772	777	50 %	0 %	0 %	50 %	336176125
8	NC_015664	ACCG	2	8	810	817	25 %	0 %	25 %	50 %	336176125
9	NC_015664	CGCA	2	8	847	854	25 %	0 %	25 %	50 %	336176125
10	NC_015664	CGG	2	6	863	868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176125
11	NC_015664	TGC	2	6	1066	1071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176125
12	NC_015664	GGGT	2	8	1200	1207	0 %	25 %	75 %	0 %	336176125
13	NC_015664	CT	3	6	1245	1250	0 %	50 %	0 %	50 %	336176125
14	NC_015664	TCG	2	6	1276	1281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176125
15	NC_015664	AAC	2	6	1283	1288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336176125
16	NC_015664	CGC	2	6	1394	1399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176125
17	NC_015664	GTC	2	6	1400	1405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176125
18	NC_015664	CGA	2	6	1460	1465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176125
19	NC_015664	AAACC	2	10	1478	1487	60 %	0 %	0 %	40 %	336176125
20	NC_015664	CGG	2	6	1553	1558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176125
21	NC_015664	TGC	2	6	1611	1616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176125
22	NC_015664	GGA	2	6	1631	1636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176125
23	NC_015664	CTC	2	6	1677	1682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336176125
24	NC_015664	TGGA	2	8	1689	1696	25 %	25 %	50 %	0 %	336176125
25	NC_015664	GC	3	6	1760	1765	0 %	0 %	50 %	50 %	336176125
26	NC_015664	CG	3	6	1769	1774	0 %	0 %	50 %	50 %	336176125
27	NC_015664	CGACAT	2	12	1796	1807	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	336176125
28	NC_015664	CG	4	8	1823	1830	0 %	0 %	50 %	50 %	336176125
29	NC_015664	CGGCG	2	10	1886	1895	0 %	0 %	60 %	40 %	336176125
30	NC_015664	GC	3	6	1906	1911	0 %	0 %	50 %	50 %	336176125
31	NC_015664	TGG	2	6	2026	2031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176125
32	NC_015664	CGC	2	6	2152	2157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176125
33	NC_015664	CGGGTT	2	12	2337	2348	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	336176125
34	NC_015664	CGAC	2	8	2386	2393	25 %	0 %	25 %	50 %	336176125
35	NC_015664	CGG	2	6	2421	2426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176125
36	NC_015664	ACTCC	2	10	2447	2456	20 %	20 %	0 %	60 %	336176125
37	NC_015664	TC	3	6	2508	2513	0 %	50 %	0 %	50 %	336176125
38	NC_015664	CGA	2	6	2540	2545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176125
39	NC_015664	GAC	3	9	2547	2555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176125
40	NC_015664	CAA	2	6	2561	2566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336176125
41	NC_015664	TGA	2	6	2591	2596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336176125
42	NC_015664	CGG	2	6	2600	2605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176125
43	NC_015664	CGG	2	6	2653	2658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176125
44	NC_015664	AGC	2	6	2659	2664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176125
45	NC_015664	CCCTT	2	10	2686	2695	0 %	40 %	0 %	60 %	336176125
46	NC_015664	CCA	2	6	2862	2867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176125
47	NC_015664	GCCG	2	8	2960	2967	0 %	0 %	50 %	50 %	336176125
48	NC_015664	CCG	2	6	2981	2986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176125
49	NC_015664	CCGA	2	8	3015	3022	25 %	0 %	25 %	50 %	336176125
50	NC_015664	CG	3	6	3047	3052	0 %	0 %	50 %	50 %	336176125
51	NC_015664	CGG	2	6	3092	3097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176125
52	NC_015664	CGG	2	6	3174	3179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176125
53	NC_015664	C	6	6	3226	3231	0 %	0 %	0 %	100 %	336176125
54	NC_015664	ACG	2	6	3292	3297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176125
55	NC_015664	TCA	2	6	3373	3378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176125
56	NC_015664	TAC	2	6	3399	3404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176125
57	NC_015664	GGAC	2	8	3538	3545	25 %	0 %	50 %	25 %	336176125
58	NC_015664	GGT	2	6	3565	3570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176125
59	NC_015664	CG	3	6	3587	3592	0 %	0 %	50 %	50 %	336176125
60	NC_015664	GGC	2	6	3629	3634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176125
61	NC_015664	G	6	6	3672	3677	0 %	0 %	100 %	0 %	336176125
62	NC_015664	CCGG	2	8	3716	3723	0 %	0 %	50 %	50 %	336176125
63	NC_015664	GC	3	6	3728	3733	0 %	0 %	50 %	50 %	336176125
64	NC_015664	CCGCG	2	10	3746	3755	0 %	0 %	40 %	60 %	336176125
65	NC_015664	CGCT	2	8	3768	3775	0 %	25 %	25 %	50 %	336176125
66	NC_015664	GCG	2	6	3828	3833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176125
67	NC_015664	GAC	2	6	3855	3860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176125
68	NC_015664	TGG	2	6	3874	3879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176125
69	NC_015664	GAC	2	6	3963	3968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176125
70	NC_015664	GTTCC	2	10	4057	4066	0 %	40 %	20 %	40 %	336176126
71	NC_015664	TCG	2	6	4098	4103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176126
72	NC_015664	GGA	2	6	4124	4129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176126
73	NC_015664	GC	3	6	4138	4143	0 %	0 %	50 %	50 %	336176126
74	NC_015664	CGG	2	6	4207	4212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176126
75	NC_015664	GCG	2	6	4255	4260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176126
76	NC_015664	CG	3	6	4259	4264	0 %	0 %	50 %	50 %	336176126
77	NC_015664	TGC	2	6	4384	4389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176126
78	NC_015664	GCA	2	6	4453	4458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176126
79	NC_015664	GCC	2	6	5799	5804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176127
80	NC_015664	GC	3	6	5858	5863	0 %	0 %	50 %	50 %	336176127
81	NC_015664	CCTGT	2	10	5886	5895	0 %	40 %	20 %	40 %	336176127
82	NC_015664	CG	3	6	5940	5945	0 %	0 %	50 %	50 %	336176127
83	NC_015664	GCA	2	6	6043	6048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176128
84	NC_015664	T	6	6	6049	6054	0 %	100 %	0 %	0 %	336176128
85	NC_015664	AGGC	2	8	6076	6083	25 %	0 %	50 %	25 %	336176128
86	NC_015664	GCG	2	6	6145	6150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176128
87	NC_015664	GC	3	6	6152	6157	0 %	0 %	50 %	50 %	336176128
88	NC_015664	GGT	2	6	6189	6194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176128
89	NC_015664	CG	3	6	6252	6257	0 %	0 %	50 %	50 %	336176128
90	NC_015664	C	6	6	6289	6294	0 %	0 %	0 %	100 %	336176128
91	NC_015664	TCCG	2	8	6393	6400	0 %	25 %	25 %	50 %	336176128
92	NC_015664	GGTCT	2	10	6751	6760	0 %	40 %	40 %	20 %	336176129
93	NC_015664	CGC	2	6	6805	6810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176129
94	NC_015664	TCCGC	2	10	6870	6879	0 %	20 %	20 %	60 %	336176129
95	NC_015664	TCG	2	6	6947	6952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176129
96	NC_015664	CGTG	2	8	6978	6985	0 %	25 %	50 %	25 %	336176129
97	NC_015664	CCAC	2	8	7019	7026	25 %	0 %	0 %	75 %	336176129
98	NC_015664	CACC	2	8	7039	7046	25 %	0 %	0 %	75 %	336176129
99	NC_015664	CGGC	2	8	7074	7081	0 %	0 %	50 %	50 %	336176129
100	NC_015664	TCC	2	6	7091	7096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336176129
101	NC_015664	CTT	2	6	7101	7106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336176129
102	NC_015664	CGT	2	6	7107	7112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176129
103	NC_015664	CCGG	2	8	7147	7154	0 %	0 %	50 %	50 %	336176129
104	NC_015664	CTC	2	6	7186	7191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336176129
105	NC_015664	GC	3	6	7245	7250	0 %	0 %	50 %	50 %	336176129
106	NC_015664	CTT	2	6	7363	7368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336176129
107	NC_015664	CCGG	2	8	7423	7430	0 %	0 %	50 %	50 %	336176129
108	NC_015664	TGG	2	6	7484	7489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176129
109	NC_015664	CAC	2	6	7498	7503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176129
110	NC_015664	CG	3	6	7516	7521	0 %	0 %	50 %	50 %	336176129
111	NC_015664	CTT	2	6	7567	7572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336176129
112	NC_015664	CAC	2	6	7592	7597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176129
113	NC_015664	TCG	2	6	7628	7633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176129
114	NC_015664	ATG	2	6	7634	7639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336176129
115	NC_015664	TCC	2	6	7658	7663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336176129
116	NC_015664	CTG	2	6	7678	7683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176129
117	NC_015664	CGG	2	6	7695	7700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176129
118	NC_015664	CGATG	2	10	7705	7714	20 %	20 %	40 %	20 %	336176129
119	NC_015664	GC	3	6	7725	7730	0 %	0 %	50 %	50 %	336176129
120	NC_015664	TCG	2	6	7746	7751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176129
121	NC_015664	GACG	2	8	7781	7788	25 %	0 %	50 %	25 %	336176129
122	NC_015664	GAT	2	6	7858	7863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336176129
123	NC_015664	GTG	2	6	7913	7918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176129
124	NC_015664	CGTC	2	8	7962	7969	0 %	25 %	25 %	50 %	336176129
125	NC_015664	CG	3	6	7976	7981	0 %	0 %	50 %	50 %	336176129
126	NC_015664	GTC	2	6	8029	8034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176129
127	NC_015664	GGA	2	6	8035	8040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176129
128	NC_015664	G	6	6	8067	8072	0 %	0 %	100 %	0 %	336176129
129	NC_015664	GCT	2	6	8172	8177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176129
130	NC_015664	CTC	2	6	8182	8187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336176129
131	NC_015664	CCCA	2	8	8189	8196	25 %	0 %	0 %	75 %	336176129
132	NC_015664	CCG	2	6	8268	8273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176129
133	NC_015664	TCA	2	6	8313	8318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176129
134	NC_015664	CACC	2	8	8353	8360	25 %	0 %	0 %	75 %	336176129
135	NC_015664	ACGGCG	2	12	8402	8413	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	336176129
136	NC_015664	GGT	2	6	8422	8427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176129
137	NC_015664	GGGTC	2	10	8430	8439	0 %	20 %	60 %	20 %	336176129
138	NC_015664	GCC	2	6	8479	8484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176129
139	NC_015664	GGTGC	2	10	8485	8494	0 %	20 %	60 %	20 %	336176129
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143	NC_015664	GGT	2	6	8557	8562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176129
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.